Simplemente deben escribir en su consola:

ffmpeg -f oss -i /dev/dsp audio.ogg

Donde:

-f indica el formato de entrada, en este caso OSS (Open Sound System).
-i indica el dispositivo de entrada, en este caso DSP (Digital Signal Processor), se encarga de convertir la señal del micrófono en una señal digital.

via: Linuxers.org